微生物(Micro-Organism)實驗（experiment)室良好的通風是關鍵（解釋:比喻事物的重要組成部分)，必要時更應配備抽風機(Draught Fan)。接種、分離及鑒定特殊結構:莢膜、鞭毛、菌毛等操作應在生物安全柜中進行，對結核桿菌等傳染性極強的微生物學檢驗時必須在100％外臨床微生物學實驗室接觸多種有害微生物，為了防止交叉污染，保護工作人員健康，實驗室應至少劃分成3個區。
一、清潔區
包括辦公室、休息室、培養基配制室與試劑儲藏室。此區域禁止帶人特殊結構:莢膜、鞭毛、菌毛（fungus)檢驗標本。
二、操作區
（1）整潔：微生物(Micro-Organism)操作區是各種病原菌相對集中的地方，為了減少粉塵流動，防止交叉污染，操作區應與外界分開。實驗室工作人員進入操作區應換鞋，送標本人員不進入操作區，操作區地面用專用拖把每天拖1次，每周用消毒劑擦洗1次。每天早上工作前，用紫外線（Ultraviolet rays)照射30min，或每天工作后，用紫外線照射60min，對整個操作區進行消毒；下午工作結束后用消毒液消毒工作臺面，以保證工作環境的安全清潔。
（2）光線：細菌培養的細小菌落及血清試驗凝集顆粒的觀察，都需要有充足的光線。操作區除設置常規照明燈外，還必須安裝操作臺燈，以保證實驗結果的正確判斷。
（3）通風：由于各種病原菌（fungus)集中，空氣污濁，實驗室要求保持排的生物安全柜中進行。實驗室集中供氣配有專門的控制設備，以排除每次更換氣瓶時引入的雜質，確保管路氣體終端的純度。不間斷氣體供應,氣體控制系統可以手動或自動進行切換，以保證氣體連續供給。氣體壓力穩定,系統采用集中降壓，亦可采用兩級減壓方式供氣，供氣更加穩定流暢。
（4）溫度（temperature)和濕度：由于無菌（fungus)操作的要求，實驗過程中經常使用酒精燈，因此，微生物(Micro-Organism)學實驗室不能安裝吊扇。為了達到實驗所需的適宜溫度，尤其是滿足某些儀器對溫度濕度的要求，實驗室應安裝空調。
（5）電源：要求提供穩壓、恒頻的電源；根據儀器設備要求，必要時配備不間斷電源。實驗室建設包括技術和設備的更新，研究人員增加和現有研究員的能力提高等。實驗室建設原則是滿足實驗室工作業務流程的優化及日常管理等方面的需要。設計主要考慮實驗室的工藝流程、特殊實驗室和功能間的位置選擇、建筑物內上層和下層的具體環境、建筑結構等因素。
（6）水源：操作區內須設置水源。用于標本處理（如細菌染色）的水槽與工作人員洗手用的水槽不能混用。
（7）污染物處理：操作區須備有消毒缸，以處理沾有活菌的玻片等污染物品。實驗室集中供氣通過供氣控制系統可以充分使用氣體，減少殘余的氣體，更科學更穩定更安全可以大大降低成本，避免安全隱患。所有氣源集中在同一地方便于管理，管路設計科學方便用氣輸出，大大降低勞動強度。檢驗剩余的標本及使用過的帶菌平板、試管均須集中地點安全放置，經消毒滅菌處理后再洗滌(washing)或丟棄。
三、無菌區
（1）無菌(意思:沒有活菌)（fungus)室應完全封閉，進出無菌室至少要經兩道門，中間隔有緩沖間，無菌室與外間設置一個可開閉的窗口，用于傳遞（transmission)器具。
（2）無菌(意思:沒有活菌)室必須保持整潔。工作人員進入無菌室應換專用鞋、專用衣。無菌室使用前須用紫外線消毒30min，操作結束后清潔臺面，再用紫外線消毒30min。定期用乳酸或甲醛(Formaldehyde)熏蒸，徹底（thorough)消毒。
（3）無菌室僅用于培養基分裝等無菌操作，不能進行有菌標本的操作。操作人員操作時應嚴格關門，并戴好專用的口罩、帽子。
（4）無菌室內應有空氣過濾裝置，并安裝空調。